Εξερευνήστε τη βιολογία σκωλήκων

Ο ιστότοπος WormBase είναι αφιερωμένος στην ομώνυμη κοινοπραξία επιστημόνων από τους χώρους της Βιολογίας και της Πληροφορικής, η οποία είναι αφιερωμένη στον εφοδιασμό της επιστημονικής κοινότητας με ακριβείς πληροφορίες και δεδομένα γύρω από το χώρο της Γενετική, Γενομικής και Βιολογίας του νηματώδους Καινοραβδίτη σκώληκα (Caenorhabditis elegans) καθώς και σχετικών άλλων νηματώδων.

Ιδρύθηκε το 2000 και καθοδηγείται από διακεκριμένα μέλη του πανεπιστημίου CalTech, των ινστιτούτων EBI, Wellcome Trust Sanger και Ontario Institute of Cancer Research.

Για το κάθε είδος νηματωειδούς σκώληκα, ο χρήστης μπορεί να έχει πρόσβαση σε

• άρθρα (όχι πάντα ανοικτής πρόσβασης) από διάφορες πηγές,
• αλληλουχία γονιδιωμάτων,
• γονίδια (σε GFF3 μορφή),
• αλληλουχίες πρωτεϊνών (σε FASTA μορφή),
• υπολογιστικά εργαλεία για αναζήτηση πληροφοριών και σχετικής αρθρογραφίας:
  • Genome Browser
  • Textpresso
• καθώς και μία πλήρη προγραμματιστική διεπαφή (API) για ανάπτυξη επιπλέον εφαρμογών με χρήση των παρεχώμενων δεδομένων.

Η βάση δεδομένων ανανεώνεται κάθε 2 μήνες.

Ο ενδιαφερόμενος επιστήμονας του χώρου μπορεί επίσης να συνεισφέρει στην όλη προσπάθεια τα δεδομένα της δικιάς του ερευνητικής δραστηριότητας, έχοντας μάλιστα την ευκαιρία να δημοσιεύσει τα αποτελέσματά του μέσω της πλατφόρμας micropublication.

 

Advertisement